ORFeome > trim2 – XORFeome 2.0
trim2 – XORFeome 2.0
General Information
| Species: |
Xenopus tropicalis tripartite motif-containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:79572 IMAGE:6978769), complete cds |
| Gene Symbol: |
trim2 |
| Gene ID: |
448181 |
| ORF gb_acc: |
|
| ORF ID: |
11152 |
ORF full-length analysis tests
| Clone type: |
Putative Full Length |
| XGC accession: |
BC075100 |
Library Location
| Plate ID: |
GDExt11011 |
| Well Location: |
C07 |
EST Sequences
| Clone: |
MGC:79572 IMAGE:6978769 |
| Trimmed Sequence: |
ATGGCCAGTGAAGGCTCCAATATTCCCAGTCCTGTGGTGCGTCAGATAGACAAGCAGTTTCTTATCTGCAGTATATGCCTCGACCGATATAAAAATCCAAAGGTACTTCCCTGTCTGCACACATTTTGTGAAAGGTGTTTGCAGAACTACATTCCAGCCCACAGCTTGACCCTTTCTTGCCCTGTCTGCCGCCAGACATCAATCTTGCCTGAGAAGGGTGTCTCTGCTCTACAGAATAACTTTTTCATTACTAACCTGATGGATGTGCTGCAGCGGAGCCCAGATAATGGCATTGAGGAATCCTCCATTCTGGAGACCGTGAGCGCTGTTGCGGCAGGAAAGCCATTGTCCTGTCCCAACCATGATGGAAATGTGATGGAATTTTACTGCCAATCATGTGAAACTGCTATGTGCCAAGATTGTACTGGAGGGGAACATGCTGAGCACCCTACTGTGCCACTTAAAGACGTGGTGGAACAACACAAAGCTGCACTACAGGCACAGCTGGATGCTGTCAAGAAAAGGTTACCTGAGATTGATTCTGCTCTTCAGTGTGTGTCTGAAATTGTAAATCAGTTAGCATCACAAAAGACTAGTATTGTTGAAGAAATACACTCAACCTTTGATGATCTGCAGAAAACCCTAAATGTGCGCAAAAGCGTCCTTCTCATGGAACTTGAAGTGAACTATGGTCTGAAACATAAAGTTCTCCAAGCACAGCTTGATACATTAATTGAAGGTCAGGAGAGTATTAAAAGTTGCACAACATTTACCGCACAGGCACTTAACCATGGAACAGAAACAGAGGTTTTGTTAGTAAAGAAACAGATGAGTGACAAACTGAATGAGTTGGCAGAACAGGATTTCCCATTACAACCACATGAGAATGACCAGCTGGACTTTATTGTGGAAACAGAGGGATTGAAAAAGTCCATTCACAACCTTGGAACTATCTTAACCACAAATGCTGTGGCCTCTGAAACAGTAGCCACTGGGGAAGGGTTGAGGCAAAGTGTGATTGGACAACCAATGTCAGTCACCATAACGACAAAAGACAAAGATGGAGAACTGTGCAAGACTGGAAGTGCTTACATTTCAGCAGAGCTATTCACACCGGATGGTAGTGTTACTGATGGTGAAGTAGTTGATAATAAAAATGGTACATATGAATTTTCATATACAATTCCAACAGAAGGTGATTTCACTCTTTCCCTAAGACTTTATGATCAACACATTAAGGGAAGCCCCTTTAAACTCAAAGTAGTTAAATCAGCAGATGTTTCACCCACAACAGAAGGAGTTAAAAGGAGGGTGAAATCACCTGGAAGCGGTCATGTCAAACAGAAAGCAGTAAAGAGGCCTGCCAGTATGTATAGCACAGGAAAACGGAAAGAAAATCCTATAGAAGATGACTTAATCTTCAGAGTTGGATCTCGTAAAGATGAAGATGTTCGTTCGCTTACAGGAACCAAGGGAAGAAATAAAGGTGAATTTACAAATCTTCAGGGGGTGGCAGCATCGACAAATGGAAAAATCCTTATAGCAGACAGTAACAACCAGTGTGTTCAGATATTTTCAAATGATGGACAGTTTAAAAGCCGCTTCGGTATTCGAGGCAGGTCCCCAGGTCAGCTACAGCGACCAACAGGAGTAGCTGTACATCCAAGTGGTGACATCATCATTGCAGACTATGATAACAAGTGGGTCAGCATCTTCTCAGCAGATGGCAAATTTAAGACCAAAATTGGATCGGGAAAACTTATGGGACCCAAAGGTGTTTCTGTTGATCGCAATGGCCACATCATTGTGGTGGACAACAAAGCCTGCTGTGTGTTTATTTTCCAGCCAAATGGAAAAATTGTAACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAATGGGGACAAACAGTTTGCAGGTACACTCGATGGTCCTCATTTTGCAGCTGTCAACAGTAATAATGAAATAATTGTGACGGACTTTCATAACCACTCAGTTAAGGTATTCAACCAAGACGGTGAGTTCATATTAAAGTTTGGCTCAAATGGAGAGGGCAATGGCCAGTTCAATGCTCCAACTGGAGTTGCAGTGGATTCCAATGGAAATATCATTGTAGCTGACTGGGGGAACAGCAGGATACAGGTTTTTGATGGAAGTGGGTCGTTTTTATCTTATATTAATACATCTGCTGACCCACTCTATGGGCCTCAGGGACTTTCCCTGACATCGGATGGTCATGTGGTTGTAGCAGACTCGGGAAACCATTGCTTCAAAGTTTATCGATACCTGCAGTAG |
| Full Trace Sequence: |
gtttttcacctctgtagctgatgagagagctgcagctgcctatctttttttctgctacgttttccctgtgcgtcactgctgtaccaggaatcaagcatcagccactgatacacggctgtttgagaatggctttcacatggaggactgcttgccctgcctctccctgcagtgtgcctggaaatctttactagcaaggatgatgcttttccctgtgggattttctgtctctcgttgctacaatagaatttcagcccagtatttttgctgactacatggaattgccaacgacaatggtgtgcaaggtggaagggagcttaacccacatgtcagtggtctaggatggccagtgaaggctccaatattcccagtcctgtggtgcgtcagatagacaagcagtttcttatctgcagtatatgcctcgaccgatataaaaatccaaaggtacttccctgtctgcacacattttgtgaaaggtgtttgcagaactacattccagcccacagcttgaccctttcttgccctgtctgccgccagacatcaatcttgcctgagaagggtgtctctgctctacagaataactttttcattactaacctgatggatgtgctgcagcggagcccagataatggcattgaggaatcctccattctggagaccgtgagcgctgttgcggcaggaaagccattgtcctgtcccaaccatgatggaaatgtgatggaattttactgccaatcatgtgaaactgctatgtgccaagattgtactggaggggaacatgctgagcaccctactgtgccacttaaagacgtggtggaacaacacaaagctgcactacaggcacagctggatgctgtcaagaaaaggttacctgagattgattctgctcttcagtgtgtgtctgaaattgtaaatcagttagcatcacaaaagactagtattgttgaagaaatacactcaacctttgatgatctgcagaaaaccctaaatgtgcgcaaaagcgtccttctcatggaacttgaagtgaactatggtctgaaacataaagttctccaagcacagcttgatacattaattgaaggtcaggagagtattaaaagttgcacaacatttaccgcacaggcacttaaccatggaacagaaacagaggttttgttagtaaagaaacagatgagtgacaaactgaatgagttggcagaacaggatttcccattacaaccacatgagaatgaccagctggactttattgtggaaacagagggattgaaaaagtccattcacaaccttggaactatcttaaccacaaatgctgtggcctctgaaacagtagccactggggaagggttgaggcaaagtgtgattggacaaccaatgtcagtcaccataacgacaaaagacaaagatggagaactgtgcaagactggaagtgcttacatttcagcagagctattcacaccggatggtagtgttactgatggtgaagtagttgataataaaaatggtacatatgaattttcatatacaattccaacagaaggtgatttcactctttccctaagactttatgatcaacacattaagggaagcccctttaaactcaaagtagttaaatcagcagatgtttcacccacaacagaaggagttaaaaggagggtgaaatcacctggaagcggtcatgtcaaacagaaagcagtaaagaggcctgccagtatgtatagcacaggaaaacggaaagaaaatcctatagaagatgacttaatcttcagagttggatctcgtaaagatgaagatgttcgttcgcttacaggaaccaagggaagaaataaaggtgaatttacaaatcttcagggggtggcagcatcgacaaatggaaaaatccttatagcagacagtaacaaccagtgtgttcagatattttcaaatgatggacagtttaaaagccgcttcggtattcgaggcaggtccccaggtcagctacagcgaccaacaggagtagctgtacatccaagtggtgacatcatcattgcagactatgataacaagtgggtcagcatcttctcagcagatggcaaatttaagaccaaaattggatcgggaaaacttatgggacccaaaggtgtttctgttgatcgcaatggccacatcattgtggtggacaacaaagcctgctgtgtgtttattttccagccaaatggaaaaattgtaaccaggtttggtagccgaggaaatggggacaaacagtttgcaggtacactcgatggtcctcattttgcagctgtcaacagtaataatgaaataattgtgacggactttcataaccactcagttaaggtattcaaccaagacggtgagttcatattaaagtttggctcaaatggagagggcaatggccagttcaatgctccaactggagttgcagtggattccaatggaaatatcattgtagctgactgggggaacagcaggatacaggtttttgatggaagtgggtcgtttttatcttatattaatacatctgctgacccactctatgggcctcagggactttccctgacatcggatggtcatgtggttgtagcagactcgggaaaccattgcttcaaagtttatcgatacctgcagtagctaaggggccatagctttatggtaaaactgcattgcatttgaaccagcaccttcatgcaagattgattgggaaaaaaatcatgcttcttaagaagtgaactccaaaagactttgattttatttaaccacgtttacggtctggtgatgacttgcttttgtttaaagtgtttcatcgctatgaattcaaagtgggcttgtaaacgtacaaggggatggcattaacatgttagaggaaccttaacacaaaaatgtaaatgactcatcttgtgcacttaggtcttagaccttttagaatatatactcatggaatggcgactccatatgcgagtttccaaataattattaaccagttgttatacatatctctccaatgctgaaatctgaaagtcttctaatccatgtatattggtagctgttgtgttataaagtagattgtacaactgtacattaatatagcattgcaaagaacagtgtaatcagtacaacatttttaagctgttgtcatgtttgtaattattacacaaatctaagcagccttataaggccatgtgcatttctatttattctgtgggaaactgatataatgagcatacattcagtacatattgtttcatttcatgcattctgacaatattatttttttataaaacagaaaaaatacaagtttcatattaaaacgtattcatagttttttttttttacttctaatttcccatgaggtcatgctttattaataacttactatagggaagcaaaaagggaatccgaacaatattgcatgctcccttcctaataagacatcttaacatataaacattgttcttaatataatgaaagcagaaagacaacgtaggctgccttgaaatggataaatagccatatgaaaattgggttgggtgagttgcatcttaatagcactttccaacaatttgagtacaacagtaattctgataatctgattgaaataatttgaatctgaaaaaatagaaattatcaaggtgggaggatcgtatctaaaattttttttccccctgtgcacaccttttgccttacatctttttggtagtgaaaagaaacataaaggtgaactggtaaatgtatggttttaggctatagaattgcctgaaatcagggaaaggtggatctgttgggaaaagctttgtctgttttaaagtaagattttgataaaataaacatttttcagttttttgaaggaacactggaatgatatgttttaatcatgtctttgaaattctgtaaatcgcatttgaccaataaatggcaaaataacgacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa |
| Translation: |
MASEGSNIPSPVVRQIDKQFLICSICLDRYKNPKVLPCLHTFCERCLQNYIPAHSLTLSCPVCRQTSILPEKGVSALQNNFFITNLMDVLQRSPDNGIEESSILETVSAVAAGKPLSCPNHDGNVMEFYCQSCETAMCQDCTGGEHAEHPTVPLKDVVEQHKAALQAQLDAVKKRLPEIDSALQCVSEIVNQLASQKTSIVEEIHSTFDDLQKTLNVRKSVLLMELEVNYGLKHKVLQAQLDTLIEGQESIKSCTTFTAQALNHGTETEVLLVKKQMSDKLNELAEQDFPLQPHENDQLDFIVETEGLKKSIHNLGTILTTNAVASETVATGEGLRQSVIGQPMSVTITTKDKDGELCKTGSAYISAELFTPDGSVTDGEVVDNKNGTYEFSYTIPTEGDFTLSLRLYDQHIKGSPFKLKVVKSADVSPTTEGVKRRVKSPGSGHVKQKAVKRPASMYSTGKRKENPIEDDLIFRVGSRKDEDVRSLTGTKGRNKGEFTNLQGVAASTNGKILIADSNNQCVQIFSNDGQFKSRFGIRGRSPGQLQRPTGVAVHPSGDIIIADYDNKWVSIFSADGKFKTKIGSGKLMGPKGVSVDRNGHIIVVDNKACCVFIFQPNGKIVTRFGSRGNGDKQFAGTLDGPHFAAVNSNNEIIVTDFHNHSVKVFNQDGEFILKFGSNGEGNGQFNAPTGVAVDSNGNIIVADWGNSRIQVFDGSGSFLSYINTSADPLYGPQGLSLTSDGHVVVADSGNHCFKVYRYLQ |
| Donor tissue: |
tailbud |
