ORFeome > LOC100036976 ORF1 – XORFeome v1.0

LOC100036976 ORF1 – XORFeome v1.0

General Information

Species: Xl
Gene Symbol:
Gene ID: 6255843
Gene Page ID:
ORF Xenbase ID: 17254509

ORF full-length analysis tests

Full-Length confidence: high
Original XGC clone accession: BC129752
Original XGC clone length: 1020

Human orthology & disease relationships

NCBI Entrez ID:
Ensembl gene IDs:
Directly associated (OMIM) disease MIM numbers:
Indirectly associated (Lage, et al.) disease MIM numbers:

Library Location

Plate ID: GDExl11093
Well Location: G02

Sequences - 5ʹ (forward) EST

Accession: JZ838916
dbEST ID: 79656618
Trimmed Sequence: ATGGTTCCAAAGACACAATTTTTTGCATTTTTACTATGTGTGCTGGCTATTGGCTTCCTCTATAAGATCACTTTTAAAGAGAACACTTTCAACCTCAGAACTTTATTTTTCCCTGCAAAGATTACCCCAGAGGACATTTTATATGCAGGGAATGGCATCATGTTTGTAGAGACCACAGACCGGATGGATCCACCTCATCTAGTGTTGTGTTCCATTGAGTCAGCAGCCCGTGTGTACCCTGATAGACCGGTGGCTTTCTTCATGAAAGGTTTAACAGACATAAACTCAAAAGAAGATGAGGACAAAGCACGGATGAGTTACCCAACACTTTTACCTTATGATAATATCTACTTTTTCCCTCTCAGAATGAATAAATTGCTTAACAATACTCCACTTATGCCCTGGTATCAAAAGGTTAATCCTAACACTGAGATGTATTGGAATCATGTGAGCTCAGATGCATGCAGGTTGGCCCTCATTTATAAGTATGGCGGCCTTTATATGGACACTGATATTATAACATTTCGTCCATGTCCAGAAAAAAACTTTCTAGCTGCTGAGGTATCTCAGATGACTGGCAGTGCTGTACTTGCATTTACTCCTCATCACACAATTGTCTGGCAGGTCATGGAAGACTTTGTCAACGGTTATTGATGGGACTGTCTGGGGGACACAAAGACCATTACTCTACCACCGAATTCCTAAATAAATTTTAATGCAAAATACCCTCCATTCCAAGCCAAAAAAGAATATAAGGGGGTGGGAACAATCTTAATTTTTTTAATAATTTAAAACAA
Full Trace Sequence: CTCGAGGCCCCAATAATGATTTTATTTTGACTGATAGTGACCTGTTCGTTGCAACAAATTGATGAGCAATGCTTTTTTATAATGCCAACTTTGTACAAAAAAGTTGGCACCATGGTTCCAAAGACACAATTTTTTGCATTTTTACTATGTGTGCTGGCTATTGGCTTCCTCTATAAGATCACTTTTAAAGAGAACACTTTCAACCTCAGAACTTTATTTTTCCCTGCAAAGATTACCCCAGAGGACATTTTATATGCAGGGAATGGCATCATGTTTGTAGAGACCACAGACCGGATGGATCCACCTCATCTAGTGTTGTGTTCCATTGAGTCAGCAGCCCGTGTGTACCCTGATAGACCGGTGGCTTTCTTCATGAAAGGTTTAACAGACATAAACTCAAAAGAAGATGAGGACAAAGCACGGATGAGTTACCCAACACTTTTACCTTATGATAATATCTACTTTTTCCCTCTCAGAATGAATAAATTGCTTAACAATACTCCACTTATGCCCTGGTATCAAAAGGTTAATCCTAACACTGAGATGTATTGGAATCATGTGAGCTCAGATGCATGCAGGTTGGCCCTCATTTATAAGTATGGCGGCCTTTATATGGACACTGATATTATAACATTTCGTCCATGTCCAGAAAAAAACTTTCTAGCTGCTGAGGTATCTCAGATGACTGGCAGTGCTGTACTTGCATTTACTCCTCATCACACAATTGTCTGGCAGGTCATGGAAGACTTTGTCAACGGTTATTGATGGGACTGTCTGGGGGACACAAAGACCATTACTCTACCACCGAATTCCTAAATAAATTTTAATGCAAAATACCCTCCATTCCAAGCCAAAAAAGAATATAAGGGGGTGGGAACAATCTTAATTTTTTTAATAATTTAAAACAA
Primer Sequence: GGGGACAACTTTGTACAAAAAAGTTGGCACCATGGTTCCAAAGACACAA

Sequences - 3ʹ (reverse) EST

Accession: JZ838915
dbEST ID: 79656617
Trimmed Sequence: TGGCACATATTTAAGGTAGGTAGGTTTATTTTCAAGAACAGCTTGATATGTTATGGGGCAGTACTGTTTGTAAAGAAGCTCCACCATTGTTTTGCTTCCAGGGACCATCACTTTACGATCATTTTTATTAGCATAATTAAAAAGATGCAAAGCATACGAGTTAATGAAAGTTGGCAGCTTTTCACAAACTTCAAAGAACTTTTTCCACTGCATACCTGGGACCGGAAAAAATCGTTCAATATTTAAAAATAAGATTGTTCCACACATTATATCTTCTTGGCCTTTGAATGGAGGTACTTTGCAATAAAATTTATTAAGAATTCGGTTGTAGAGTAATGGTCCTTGTTGTCCCCAGACAGTCCCATCATAACCGTTGACAAAGTCTTCCATGAACTGCCAGACAATTGTGTGATGAGGAGTAAATGCAAGTACAGCACTGCCAGTCATCTGAGATACCTCAGCAGCTAGAAAGTTTTTTTCTGGACATGGACGAAATGTTATAATATCAGTGTCCATATAAAGGCCGCCATACTTATAAATGAAGGCCAACCTGCATGCATCTGAAGCTCACATGATTCCCATACCTCTCAGTGGTTAGGATTAACCTTTTGATACCGGGGGAGAGGTGGAGTAGTGGTAAACAATTTATTCCTTCCGGAAAGGGAAAAAATAAAATTTAATAATAAAGGAAAAATTGGTGGGGGAAACTCAACCCGTGGCTTTTGTCCCCACACCTTCCTTTTTTGAAGTTTAAGT
Full Trace Sequence: GGAGGAAAAGTCTATGGACCATGTAATACGACTCACTATAGGGGGATATCAGCTGGGATGGCAAATAATGATTTTATTTTGACTGATAGTGACCTGTTCGTTGCAACAAATTGATAAGCAATGCTTTCTTATAATGCCAACTTTGTACAAGAAAGTTGGCAATGGCACATATTTAAGGTAGGTAGGTTTATTTTCAAGAACAGCTTGATATGTTATGGGGCAGTACTGTTTGTAAAGAAGCTCCACCATTGTTTTGCTTCCAGGGACCATCACTTTACGATCATTTTTATTAGCATAATTAAAAAGATGCAAAGCATACGAGTTAATGAAAGTTGGCAGCTTTTCACAAACTTCAAAGAACTTTTTCCACTGCATACCTGGGACCGGAAAAAATCGTTCAATATTTAAAAATAAGATTGTTCCACACATTATATCTTCTTGGCCTTTGAATGGAGGTACTTTGCAATAAAATTTATTAAGAATTCGGTTGTAGAGTAATGGTCCTTGTTGTCCCCAGACAGTCCCATCATAACCGTTGACAAAGTCTTCCATGAACTGCCAGACAATTGTGTGATGAGGAGTAAATGCAAGTACAGCACTGCCAGTCATCTGAGATACCTCAGCAGCTAGAAAGTTTTTTTCTGGACATGGACGAAATGTTATAATATCAGTGTCCATATAAAGGCCGCCATACTTATAAATGAAGGCCAACCTGCATGCATCTGAAGCTCACATGATTCCCATACCTCTCAGTGGTTAGGATTAACCTTTTGATACCGGGGGAGAGGTGGAGTAGTGGTAAACAATTTATTCCTTCCGGAAAGGGAAAAAATAAAATTTAATAATAAAGGAAAAATTGGTGGGGGAAACTCAACCCGTGGCTTTTGTCCCCACACCTTCCTTTTTTGAAGTTTAAGT
Primer Sequence: GGGGACAACTTTGTACAAGAAAGTTGGCAATGGCACATATTTAAGGTAGGTAG